Observation · 个人观察

我们测到了什么?

一种由大规模细胞核群体统计分布呈现出的谱特征:RSi Tail Runaway

一个具体案例

Tail Closed 和 Tail Runaway 实际长什么样?

四个真实样本,跑同一套流程,没有任何人工调整:两个来自 TCGA(确诊肿瘤),两个来自 GTEx(独立的健康供体组织参考库)。同一台仪器,同一套规则,事先不知道哪个是哪个。

Runaway 案例——确诊肿瘤

TCGA-B3-3925-01Z-00-DX1

  • Spectrum State🔴 RUNAWAY
  • RSi P9963.939
  • Mean RSi4.880
  • Tail Width (P99–P50)62.010
  • High-Defect Tail Occupancy (Concavity >10)78.490%
  • Mean Concavity12.900

TCGA-49-4488-01Z-00-DX10

  • Spectrum State🔴 RUNAWAY
  • RSi P9939.265
  • Mean RSi3.112
  • Tail Width (P99–P50)37.934
  • High-Defect Tail Occupancy (Concavity >10)60.540%
  • Mean Concavity11.271

Closed 案例——健康供体参考

GTEX-11GSO-0526

  • Spectrum State🟢 COMPACT
  • RSi P991.486
  • Mean RSi0.508
  • Tail Width (P99–P50)1.222
  • High-Defect Tail Occupancy (Concavity >10)1.700%
  • Mean Concavity5.759

GTEX-117XS-2226

  • Spectrum State🟢 COMPACT
  • RSi P991.574
  • Mean RSi0.285
  • Tail Width (P99–P50)1.374
  • High-Defect Tail Occupancy (Concavity >10)0.780%
  • Mean Concavity5.812
两组之间没有重叠,即使组内样本并不完全相同。两个肿瘤样本的 RSi P99 在 39 到 64 之间,两个健康组织样本的 RSi P99 在 1.49 到 1.57 之间——肿瘤组内部波动较大,健康组内部高度集中,但两组之间没有任何重叠。四个样本都是 10,000 个细胞核。
四个样本,不是统计结果。这展示的是"Tail Closed"和"Tail Runaway"具体长什么样,以及这种区分在个体样本存在自然波动的情况下依然成立——本身并不构成对完整队列普遍规律的证据。完整的样本数量与统计结果另行报告;如何在自己的数据上重复这个结果,见公开验证页面。
Observation 01

Tail Runaway 是一种统计谱读出

它不是单个细胞核标签,也不是训练模型给出的癌症概率,而是大量细胞核 RSi 测量值的整体分布形态。

非癌组织

在目前分析的数据中,主要呈现 Tail Closed

癌组织

在目前分析的数据中,主要呈现 Tail Runaway

尾部状态只是其中一种读出。核态谱还有主峰位置、谱宽、可能的多峰/亚群结构、空间异质性——癌症只是目前发现的第一个有关联的谱特征(尾部),不是这台仪器唯一能读出的东西。谱的其他特征未来可能对别的问题有信息量,比如癌前变化、炎症、衰老、药物反应、发育、组织损伤与修复——这些目前尚未探索,不是已有的结论。
Observation 02

在目前个人分析的癌症数据中,它反复出现

截至目前,在本人已分析的癌症样本中,除一个已知例外外,尚未发现不呈现这一特征的反例。这一观察目前已覆盖:

这只描述本人目前分析的数据范围,不代表已经建立普遍规律,也不代表科学共同体已经确认这一对应关系。
Observation 03 · Known Boundary

已知例外:冷冻切片(Frozen Section)不成立

我们没有止步于观察一致性,而是主动尝试寻找这一规律不成立的边界。目前找到一个明确例外:TCGA 冷冻切片样本,规律不成立。

已知边界:除冷冻切片外,在人类、大鼠、狗的 SVS 样本中,跨癌种观察目前尚未发现其他例外。这提示 Tail Runaway / Tail Closed 读出可能依赖组织制备方式(冷冻 vs 石蜡包埋 FFPE),而不仅仅反映癌症本身的结构特征——这正是我们仍在界定的适用边界之一,也欢迎更多独立测试来进一步收窄或推翻它。
Observation 04

这一对应跨越多个物种与多个肿瘤类型

在本人目前分析的数据中,该现象出现在不同哺乳动物物种与不同肿瘤类型中(冷冻切片除外)。

跨多个数据集出现,不等于已经证明适用于所有癌症、所有物种和所有实验条件。

我第一次看到它时并不相信。我继续寻找反例,结果找到了一个(冷冻切片),但在其余能够分析的数据范围内没有找到。